MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY060

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016900	TCTG	2	8	15	22	0 %	50 %	25 %	25 %	377643907
2	NC_016900	CGT	2	6	54	59	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
3	NC_016900	GCT	3	9	61	69	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643907
4	NC_016900	GACG	2	8	93	100	25 %	0 %	50 %	25 %	377643907
5	NC_016900	GGA	2	6	144	149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643907
6	NC_016900	AGGA	2	8	232	239	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
7	NC_016900	CCGG	2	8	248	255	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
8	NC_016900	TGG	2	6	332	337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
9	NC_016900	GTG	2	6	349	354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643907
10	NC_016900	CCGG	2	8	377	384	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
11	NC_016900	CAC	2	6	420	425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643907
12	NC_016900	G	6	6	515	520	0 %	0 %	100 %	0 %	377643907
13	NC_016900	GC	3	6	526	531	0 %	0 %	50 %	50 %	377643907
14	NC_016900	AGGG	2	8	600	607	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
15	NC_016900	GGC	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
16	NC_016900	CGGT	2	8	815	822	0 %	25 %	50 %	25 %	377643907
17	NC_016900	GAGG	2	8	858	865	25 %	0 %	75 %	0 %	377643907
18	NC_016900	AGGA	2	8	877	884	50 %	0 %	50 %	0 %	377643907
19	NC_016900	CAG	2	6	913	918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
20	NC_016900	GGC	2	6	927	932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643907
21	NC_016900	GCC	2	6	949	954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643907
22	NC_016900	AGC	2	6	971	976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643907
23	NC_016900	TGT	2	6	1060	1065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016900	TGTA	2	8	1089	1096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016900	GAT	2	6	1130	1135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016900	CAT	2	6	1152	1157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016900	CTTCCG	2	12	1160	1171	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016900	AT	3	6	1211	1216	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016900	ATT	2	6	1253	1258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016900	CTT	2	6	1269	1274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016900	TAT	2	6	1279	1284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	377643908
32	NC_016900	ATC	3	9	1290	1298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
33	NC_016900	TGAA	2	8	1365	1372	50 %	25 %	25 %	0 %	377643908
34	NC_016900	CTGA	2	8	1391	1398	25 %	25 %	25 %	25 %	377643908
35	NC_016900	TCA	4	12	1417	1428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643908
36	NC_016900	CCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643908
37	NC_016900	A	6	6	1612	1617	100 %	0 %	0 %	0 %	377643908
38	NC_016900	A	8	8	1630	1637	100 %	0 %	0 %	0 %	377643908
39	NC_016900	T	6	6	1652	1657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016900	GTT	2	6	1680	1685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016900	GGC	2	6	1742	1747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
42	NC_016900	AGC	2	6	1764	1769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643909
43	NC_016900	TGG	2	6	1849	1854	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643909
44	NC_016900	TGCG	2	8	1886	1893	0 %	25 %	50 %	25 %	377643909
45	NC_016900	GGC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643909
46	NC_016900	GCC	2	6	1996	2001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_016900	GGC	2	6	2100	2105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016900	TCG	2	6	2110	2115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016900	GTT	2	6	2149	2154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016900	CCA	2	6	2330	2335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	377643910
51	NC_016900	GGA	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	377643910
52	NC_016900	G	7	7	2356	2362	0 %	0 %	100 %	0 %	377643910
53	NC_016900	TAA	2	6	2424	2429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	377643910
54	NC_016900	CGT	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
55	NC_016900	CGG	2	6	2480	2485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	377643910
56	NC_016900	T	6	6	2496	2501	0 %	100 %	0 %	0 %	377643910
57	NC_016900	ATG	2	6	2513	2518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
58	NC_016900	AGC	2	6	2573	2578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643910
59	NC_016900	ATC	2	6	2647	2652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643910
60	NC_016900	GTA	2	6	2738	2743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	377643910
61	NC_016900	CG	3	6	2750	2755	0 %	0 %	50 %	50 %	377643910
62	NC_016900	GT	3	6	2770	2775	0 %	50 %	50 %	0 %	377643910
63	NC_016900	TTC	2	6	2824	2829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	377643910
64	NC_016900	GCT	2	6	2844	2849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
65	NC_016900	GCC	2	6	2852	2857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	377643910
66	NC_016900	TCC	2	6	2867	2872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	377643910
67	NC_016900	GCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643910
68	NC_016900	TGG	2	6	2892	2897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	377643910
69	NC_016900	GCTC	2	8	2921	2928	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016900	AAGA	2	8	3039	3046	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016900	AATCT	2	10	3053	3062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016900	CT	3	6	3061	3066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016900	TC	3	6	3072	3077	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016900	T	6	6	3078	3083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016900	CGGG	2	8	3125	3132	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016900	CGC	2	6	3136	3141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016900	CCAG	2	8	3261	3268	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016900	CAG	2	6	3357	3362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016900	CCGG	2	8	3403	3410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016900	GCC	2	6	3430	3435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016900	TCCG	2	8	3459	3466	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016900	CGA	2	6	3497	3502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016900	CCA	2	6	3511	3516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_016900	CCA	2	6	3521	3526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016900	AGG	2	6	3535	3540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016900	CCT	2	6	3599	3604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016900	CTG	2	6	3663	3668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016900	GATCG	2	10	3683	3692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016900	GAA	2	6	3701	3706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016900	TCG	2	6	3775	3780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016900	TCA	2	6	3853	3858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	377643911
92	NC_016900	CAG	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	377643911
93	NC_016900	C	6	6	3914	3919	0 %	0 %	0 %	100 %	377643911
94	NC_016900	TCTG	2	8	3964	3971	0 %	50 %	25 %	25 %	377643911
95	NC_016900	CTG	2	6	4010	4015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	377643911
96	NC_016900	TCC	2	6	4043	4048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016900	TGT	2	6	4072	4077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016900	TTTCCG	2	12	4080	4091	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016900	GTG	2	6	4142	4147	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016900	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016900	TGCG	2	8	4204	4211	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016900	TTCC	2	8	4221	4228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.